Estructura primaria

La estructura primaria de una proteína se corresponde con la secuencia lineal de aminoácidos codificada en su correspondiente unidad de transcripción. Las proteínas naturales están constituidas por 20 aminoácidos básicos, todos ellos compuestos por un grupo amino y uno carboxilo unidos por el carbono $\alpha$ , del que parten diferentes cadenas laterales (R, ver figura 1.2). A los aminoácidos que forman parte de una secuencia se les llama residuos.

Figura 1.2: Estructura química de los aminoácidos naturales, figura tomada de http://www.friedli.com.

Una cadena polipeptídica contiene $n$ aminoácidos formando enlaces peptídicos entre el grupo carboxil del residuo $i-1$ y el amino del $i$ , como se muestra en la figura 1.3. Este enlace es rígido, pero los enlaces situados inmeditamente antes y después de él tienen grados de libertad, dando lugar a los llamados ángulos $\phi$ (fi) y $\psi$ (psi), que describen con precisión el esqueleto peptídico de una proteína. La conformación de este esqueleto está dictada principalmente por las propiedades de las cadenas laterales y sus interacciones. Las cadenas laterales pueden clasificarse como polares, no polares y cargadas.

Figura 1.3: Estructura del enlace peptídico y la cadena polipeptídica, figura tomada de http://www.friedli.com.